品种混杂、种子纯度降低会明显降低产量和品质。种子纯度越低，对产量的影响就越大。据测定：玉米杂交种纯度每下降1%，每亩减产约9千克。种子质量对产量的影响有时会超过品种间产量的差异。因此生产上不仅要选择好品种，还要选择高质量的种子。
提高玉米杂交种子纯度的技术措施有：①凡制种亲本一定要选用来源可靠，纯度、净度、发芽率高的自交系。②玉米制种田隔离区设置要安全可靠，通常利用山梁、村庄、树林等障碍物形成的自然隔离条件，必须保证安全有效。③制种户必须从苗期开始，发现杂株随时去掉，抽雄前必须把杂株全部去除干净。④在制种区对母本严格去雄是保证制种质量的中心环节，必须做到超前、及时、彻底、干净，坚持风雨无阻，每天必须上午抽一次，下午抽一次。抽出的雄穗不随地乱扔，应就地埋掉或带回家中喂牲口垫圈。父本散过粉以后及时割除父本。