在饲养过程中若发现脱肛鸡，应马上将患鸡拣出单独饲养，前3-5天逐渐减少喂料量，使母鸡停止产蛋，再进行治疗。重症鸡大都愈后不良，没有治疗价值，所以应及早淘汰。
轻度脱肛应及时用0.1%的高锰酸钾水或2%温盐水进行清洗消毒，除去表面的异物和痂皮，把母鸡倒提起来，然后将脱出物送入腹腔，然后涂上紫药水，撒敷消炎粉，以防继发感染。
严重脱肛的蛋鸡除泄殖腔脱出外，还有部分输卵管或肠管脱出。用10%食盐水清洗、复位，做烟包式缝合，缝合前必须先取出留在泄殖腔中的蛋，缝合处留出排粪孔，最后从肛门注入抗生素消炎，外涂金霉素软膏。
治疗期间要加强饲养管理，保持环境安静、干燥、温暖，供应充足、清洁饮水。