西瓜果实腐斑病发病初期在果实表面出现许多水渍状暗绿色小斑点，以后逐渐发展扩大为边缘不规则的深绿色水渍状大斑，严重时果实龟裂、腐烂。
主要为害果实。果实上病斑圆形或近圆形，大小4～8毫米，褐色至深褐色，没有边缘，发生多时常相互融合，形成大块病班，后在病部生许多小黑粒点，即病原菌的分生孢子器。
西瓜细菌性果腐病，主要为害西瓜果实、幼苗，叶片也可被害、发病初期在果实表面出现许多水渍状暗绿色小斑点，以后逐渐发展扩大为边缘不规则的深绿色水渍状大斑，严重时果实龟裂、腐烂。叶片上的病斑呈水渍状斑点，并带有黄色晕圈。幼苗被害后可导致叶片干枯，幼苗死亡。一般浅色皮瓜易感病。