目前，对猪乙型脑炎尚无特效的治疗方法。预防控制该病最有效的措施是接种疫苗；同时，要加强疫情监测，搞好环境卫生，定期消毒灭蚊，减少蚊虫叮咬；加强宿主动物管理，对病死畜禽及流产胎儿等严格进行无害化处理等，只有消灭环境中的病原体等传染源，切断猪—蚊—猪的传播链，才能有效控制该病的发生、传播与流行。
无治疗方法，一旦确诊最好淘汰。做好死胎儿、胎盘及分泌物等的处理；驱灭蚊虫，注意消灭越冬蚊；在流行地区猪场，在蚊虫开始活动前1-2个月，对4月龄以上至两岁的公母猪，应用乙型脑炎弱毒疫苗进行预防注射，第二年加强免疫一次，免疫期可达3年，有较好的预防效果。