西红柿病毒病用毒氟磷效果明显。
西红柿病毒病用宁南霉素、毒氟磷、盐酸吗啉胍、氨基寡糖素等农药防治效果较好。
预防病毒病的发生首先要采取措施防止蚜虫等虫害带来的机械损伤，然后用化学药剂开展防治。
用农用链霉素防治效果也很好的。
西红柿病毒病用农用链霉素进行防治效果比较好。
定植用地要选用未种番茄或未发生番茄病毒病的田块，对曾发生番茄病毒病的田一定要进行深翻，促使带毒病残体腐烂，有条件的施用石灰，促使土壤中病残体上的病毒钝化。避免间套作和连作，减少和避免番茄病毒病土壤和残留物的传毒，减轻病毒病的发生；育苗地和栽植棚地应彻底清除带毒杂草，减少病毒病的毒源。番茄幼苗定植后，棚内温度升高时要覆盖遮阳网，以防幼苗缺水晒伤萎蔫，确保番茄植株健壮生长，更好地抵抗番茄病毒病。要保持大棚通风顺畅，控制温度，保证番茄适宜生长温度。在整枝打杈时及时清理病株，杂草也要清理，减少粉虱等害虫的寄主植物。
主要以预防为主，首先防治蚜虫，杀虫剂可加高效氯氢菊酯等。