马铃薯晚疫病的发病主要是种子（马铃薯种薯块茎）带菌发病传播。所以选用抗病品种及脱毒种薯是十分重要且有效的。苗期可用800倍液的75%百菌清可湿性粉剂进行全田喷雾防治。发病期可用500倍液的64%杀毒矾可湿性粉剂或500倍液的25%甲霜灵可湿性粉剂交替用药进行防治。每十天喷施一次，连续二至三次，可有效控制病情的发展。
可采用农业防治和化学防治的办法。
马铃薯晚疫病用银法利，氰双唑。
马铃薯晚疫病可用代森锰锌喷雾防治。
采用烯酰吗啉或扑海因喷雾防治。
加强田间管理，做好病虫害防治。
马铃薯晚疫病可用内吸治疗杀菌剂，可选用68.75%银法利，或25%阿米西达，或56%阿米多彩，或25%凯润，或60%百泰，或18.7%凯，或52.5%抑快净喷雾。
防治马铃薯晚疫病可以使用百菌清喷施。