当归栽种时期常见的病虫害有麻口病、菌核病、虫害
（1）麻口病：移栽后的4月中旬、6月中旬、9月上旬、11月上旬为其发病高峰期，为害根部，地下害虫多有利于发病。防治方法：①每亩用3911颗粒剂3千克加细土15千克拌匀或20％甲基异柳磷乳剂0．5千克加水2.5千克喷在15千克土上拌匀，撒施，翻入土中；②定期用广谱长效杀虫剂灌根，每亩用40％多菌灵胶悬剂250克或托布津600克加水150千克，每株灌稀释液50克，5月上旬、6月中旬各灌1次。
（2）菌核病：为害叶部、低温高湿条件下易发生，7－8月为害较重。防治方法：不连作，在发病前半个月每IO天左右，连续3－4次用1000倍的50％甲基托市津喷药。
（3）虫害：主要为金针成虫和小地老虎为害。防治方法：铲除田内外青草，堆成小堆，7－10天换鲜草，用毒饵诱杀。