马铃薯用薯块作为种薯容易得疫病。
薯块容易感染病菌，腐烂，造成出苗不齐，缺苗断垄。
马薯种薯切块在生产上存在很多不足之处。当播种时土壤条件较差时，比如土壤过干或潮湿、土壤温度过低或过高，或是种薯本身抗性较差时，切块的种薯容易腐烂或失水干缩，造成出苗不整齐，田间缺苗严重，最终导致产量降低。种薯切块时若刀具不消毒会导致许多病毒、细菌性病害通过切刀在种薯间传播，若伤口不能很快愈合，切面易感染细菌导致腐烂。特别是播种时高温、高湿，容易引起大量烂种，造成田间缺苗严重甚至减产。所以在播种时要根据当年土壤墒情和天气情况合理选择。
马铃薯切块种植的缺点是容易腐烂，费时又费王。