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发生在穗颈、穗轴及枝梗上，病部成段变褐坏死，穗颈、穗轴易折断变成白穗，老百姓称为“掐脖瘟”，轻则减产10-20%，重则绝收。
水稻穗颈瘟是稻瘟病的一种形式，发生在水稻穗颈部位。穗颈瘟初期形成褐色小点，扩展后使穗颈部变褐，也造成枯白穗。发病晚的造成秕谷。枝梗或穗轴受害造成小穗不实。
