引起妊娠母猪流产的原因较多，常见的有：疾病性流产、营养性流产、管理性流产。引起疾病性流产的疾病主要有：猪的细小病毒病、猪瘟、伪狂犬病、蓝耳病、乙型脑炎、衣原体病、布氏杆菌病、钩端螺旋体病。引起营养性流产的原因主要有：饲料的营养搭配不合理，尤其是蛋白质与能量的搭配不均衡，出现高能高蛋白或者低能低蛋白饲料，容易造成母猪过肥或过瘦。过肥造成后期脂肪沉积，压迫子宫，影响胎儿的正常生长；过瘦导致胎儿后期的营养不良，发育不正常，容易成为弱仔。维生素E、钙、磷、镁的缺乏，使胎儿发生营养物质代谢障碍而引起流产。引起管理性流产的原因主要有：地面太滑、拥挤造成母猪跌倒、咬架、受惊吓或饲养员在驱赶过程中的鞭打、踢推的应激，均可使母猪的子宫及胎儿受到直接或间接的冲击震动，引起怀孕后期的母猪流产；长期伺养在阴冷、潮湿、空气不良的环境中或冬季饮用冰水等均可造成流产。
细茵、病毒感染：如伪狂犬病毒、繁殖呼吸道综合症、乙型脑炎、细小病毒、非典型猪瘟、布氏杆菌、沙门氏菌、钩端螺旋体等传染病均会引起母猪流产；寄生虫也会引起流产。毒素：（1）发霉饲料中的黄曲霉素和赤霉烯酮。猪舍内一氧化碳浓度高都可引起流产。母猪采食不足，舍内保温差也能引起流产。