病菌从子叶或幼根侵入植株，在根颈部产生黄褐色水渍状病斑，后变黑褐色，引起根基组织腐烂。当潮湿环境时，病部产生分生孢子器(即黑色小突起)，病部表皮易剥落，纤维组织外露。当环境干燥时，病部表皮凹陷，紧贴茎上，成株期感病后，约10～30天全株枯死，发病部位多在茎基部贴地面，有时也出现主茎和侧枝分期枯死现象。
花生茎腐病发病症状：1、苗期症状。幼苗出土前即可发病，病菌通常先侵染子叶，造成子叶变黑腐烂，然后侵入植株茎基部及地下根颈处，逐渐绕茎或根颈扩展形成黑褐色病斑。病斑扩展环绕茎基时，地上部萎蔫枯死。田间潮湿时，病部产生密集的黑色小粒点，即病菌分生孢子器，表皮易剥落。田间干燥时，病部皮层紧贴茎上，髓部干枯中空。2、成株期。成株期发病，先在主茎和侧枝茎基部产生黄褐色水渍状略凹陷的病斑。病斑向上、下发展，茎基部变黑枯死，纵剖根颈部，髓呈褐色干腐状，湿度大时，病株变黑腐烂。病部密生黑色小粒点。