发生于主穗梗至第一枝梗分枝的穗颈部。病斑初期呈水渍状褐色小点，以后逐渐扩展呈褐色或墨绿色。发病早的多形成白穗，发病迟的瘪粒增加，粒重降低，影响米质。穗轴、枝梗也可发病，症状与病穗颈相似。湿度大时，以上发病部位都可产生灰色霉层。此外，病菌还可侵染谷粒、护颖等。
水稻稻瘟病穗颈瘟症状:初形成褐色小点，放展后使穗颈部变褐，也造成枯白穗。发病晚的造成秕谷。
水稻穗颈瘟是稻瘟病的一种形式，发生在水稻穗颈部位。穗颈瘟初期形成褐色小点，扩展后使穗颈部变褐，也造成枯白穗。发病晚的造成秕谷。枝梗或穗轴受害造成小穗不实。