种子化学处理（酸浸泡）可以从根本上降低发病率；清除病株，一旦作物发病后要采取严格的卫生措施，例如铲除病株、病区隔离等，以使损失降低到最低程度；药剂防治，为保护作物，有必要采取预防措施，如销毁植物残体，对农具、设备消毒；与非茄科植物实行2年以上的轮作。
溃疡病的防治办法有防止机械擦伤，喷施多菌灵，甲基托布津等药物。
番茄溃疡病防治措施：1、做好种子的消毒工作。2、加强棚室管理，实行轮作，实行与非茄科蔬菜三年以上的轮作。3、合理施肥。增施磷钾肥，控制氮肥的施用量。4、及时除草，避免带露水操作。发现病株后及时拔除。适时通风透光，有利于西红柿生长，提高抗病性。
①进行种子处理，用50℃的温水浸种20分钟，待水冷却后催芽。②发病初期用50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液或60%琥●乙磷铝可湿’性粉剂500倍液，或77%氢氧化铜可湿性粉剂500倍液，或14%络氨铜水剂300倍液，或47%春雷●王铜可湿性粉剂700倍液全田喷药，每隔7～10天喷1次，连续防治3～4次。