1、窖贮
建窖应选向阳背风，干燥通风，地下水位高的高地或坡地。旧土窖须将窖墙旧土刮去一层，然后用硫磺或福尔马林熏蒸消毒。将收获后的红薯，选无病伤的薯块装筐，在窖堆码，或堆垛藏。为防止染病，可用1%的70%甲基托布津溶液或新科源液体保鲜剂二号浸泡薯块3分钟，捞出晾干后入贮。红薯入窖容量不可超过2/3，留出空间，以利通风排湿，防止“闷窖”。贮期调控窖温度至10-14℃，加强通风排湿，相对湿度控制在80%左右，防冻、防闷、防烂。红薯贮藏期间还要用甲胺磷等剧毒鼠药防止鼠害。工作人员下窖操作时要注意防止二氧化碳中毒。
2、屋窖贮藏
屋窖的结构与普通房屋相似，但墙壁屋顶很厚，四周密封，窗户对开，有加温用的火道，可进行高温愈伤处理。屋窖分大屋窖和小屋窖两种。小屋窖窖体小，省工省料，适合农户贮藏红薯用。小屋窖可利用旧屋的角落改建，也可新建，一般长2-3米，宽2-2.3米。如修建半地下式可向下挖0.7-1米，再垒墙。如修建地上式，可自地面向上垒墙，墙厚0.7-1米。也可垒成双层墙，中间填土或填碎草。墙高约2米，南边或东边留门。屋顶起脊，瓦顶或草顶皆可，顶厚约0.5米，房檐与屋山要包严，不能裂缝透风。前后墙要留对口窗。室内建回笼火道，室外在进火口处修建煤火灶。红薯人窖前在窖内铺荆笆或高粱秆，使薯堆不直接接触地面。薯堆中间每隔l米放一个通气筒或高粱把，堆高1.3-1.5米，上留约0.5米空间，薯堆四周不可直接靠墙。高温愈伤处理时，火要大，加温要猛，使窖温一昼夜内上升至32-35℃，薯堆上、中、下都要放置温度计，每隔1-2小时检查一次温度，保持4-6天即可促使伤口愈合。高温处理后应打开窖门及对口窗，使窖温迅速下降至15C左右，即可进入正常管理。贮藏前期，如窖温过高，可在晴天开窗散热，待窖温稳定在13℃时，应注意保温。以后随气温下降加挂门帘，并堵死出气口。天气再冷时，即应生火加温，并在薯堆上盖草保温。立春后天气转暖，在晴天可适当开窗通气。整个贮期要隔2-3天检查一次窖温，尤其应注意窖西北角下部易出现低温。
3、冷库贮藏
将经过挑选的红薯装筐，然后入库垛码或上架摆放，入库的红薯先经预伤处理，预伤后迅速将库温降到贮藏温度12-15℃，即进入正常管理阶段。注意预伤时，要撒水增湿，湿度达90-95%，正常管理时要通风降湿，湿度保持在85-90%。贮藏期为5-7个月。贮藏中如发现病薯应立即拣出，防止蔓延。